Jak to działa

Poniżej wyjaśnimy w jaki sposób to wszystko funkcjonuje. W skrócie - stworzyliśmy robota, który robi większość czynności za nas, korzystając z otwartych informacji polskiej Wikipedii.

Tworzenie listy roślin występujących w Polsce

Robot czyta nazwy łacińskie roślin wyszczególnionych w następujących artykułach z Wikipedii:

Sprawdzanie poprawności nazw i poszukiwanie synonimów

Po zebraniu nazw łacińskich roślin, robot korzysta z bazy The Plant List sprawdzając, czy dana nazwa jest nazwą główną, czy synonimem. Jeśli okazuje się synonimem - korzysta z nazwy głównej. .

Pobieranie informacji z Wikipedii

Robot ściąga artykuły dla roślin obecnych w Wikipedii, a następnie przetwarza je tak, by uzyskać jak najwięcej informacji na temat morfologii. Uzyskane w ten sposób cechy grupuje w sposób zdefiniowany przez nas i dodaje do bazy danych atlasu.

Następnie robot poszukuje taksonomii danej rośliny w bazie GBIF i dodaje wynik do bazy atlasu. W ostatnim etapie, korzystając z API Wikipedii, robot pobiera zdjęcia roślin z polskiej Wikipedii oraz z Wikimedia. Informacje o autorstwie zdjęć i zasadach udostępniania są pobierane z użyciem API wmflabs.

Dodatkowe zdjęcia robot pobiera ze strony http://www.actaplantarum.org/acta/galleria.php udostępnianych na zasadach Creative Commons Attribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 International License oraz z http://www.biolib.de udostępniającej skany z książek botanicznych, które przeszły do Domeny Publicznej.

Potwierdzanie informacji

Wpisy dotyczące nowych roślin są przeglądane przez człowieka, cechy charakterystyczne są na tym etapie ewentualnie modyfikowane. Zduplikowane zdjęcia również są usuwane. Uwaga: nie jesteśmy w stanie na bieżąco przeglądać bazy (zapraszamy do współpracy!), dlatego zawsze podchodź do prezentowanych tu informacji ostrożnie i potwierdź w innych źródłach.

Zawartość bazy danych

Baza zawiera 2726 roślin rosnących dziko bądź w uprawie na terenie Polski. Baza zawiera również 97606 miejsc występowania roślin z bazy GBIF oraz 718 wprowadzonych przez Użytkowników atlasu. Dla łatwiejszej identyfikacji, baza zawiera 75994 zdjęć (+ 4805 dodanych przez Użytkowników) różnych części roślin udostępnianych w Internecie na zasadach Creative Commons bądź będących w domenie publicznej.
Nie wszystkie rośliny występują w bazie: z informacji o roślinach występujących w Polsce [1, 2, 3] wynika, że brakuje nam około 889 roślin (zobacz poniżej jak możesz to zmienić), co więcej - w przypadku 114 roślin nie posiadamy zdjęć co znacznie utrudnia ich identyfikację (zobacz poniżej jak możesz to zmienić). Wierzymy, że z upływem czasu baza będzie systematycznie uzupełniana, m.in. dzięki Wam.

Histogram liczby cech przypisanych roślinom

Statystyki poszczególnych cech przypisanych roślinom

GrupaCecha# roślin
ogólne roślina pyłkodajna 145
ogólne roślina pospolita 1
ogólne roślina miododajna 185
ogólne Mieszaniec 2
ogólne roślina barwierska 26
ogólne pnącze 44
ogólne krzewinka 35
ogólne roślina ozdobna 787
ogólne roślina jednoroczna 1
ogólne roślina inwazyjna 94
ogólne Roślina geokarpiczna 1
ogólne drzewo 328
ogólne antropofit 1
ogólne roślina ekspansywna 72
ogólne krzew 263
ogólne kenofit 1
ogólne chwast 244
ogólne roślina wodna 134
ogólne roślina pionierska 16
ogólne roślina chroniona 128
ogólne roślina trująca 350
ogólne roślina użytkowa 1253
ogólne roślina lecznicza 542
ogólne pochodzenie: rejon śródziemnomorski 1
ogólne roślina jadalna 308
ogólne bylina 1344
ogólne roślina ruderalna 1
cechy korony gęsto ugałęziona 1
cechy korony gałęzie sięgają ziemi 1
cechy korony korona rozłożysta 1
forma życiowa wg Raunkiæra megafanerofit 2
forma życiowa wg Raunkiæra hemikryptofit 2
kolor kory szarobrązowa 1
spekania kory kora głęboko bruzdowana 1
system korzeniowy Korzenie cienkie 1
system korzeniowy liczne odrośla 1
barwa kwiatów jasnofioletowe 1
barwa kwiatów płatki białe 835
barwa kwiatów płatki różowe 396
barwa kwiatów płatki czerwone 369
barwa kwiatów płatki szkarłatne 1
barwa kwiatów płatki fioletowe 325
barwa kwiatów płatki brudnobiałe 9
barwa kwiatów płatki niebieskie 180
barwa kwiatów płatki kremowe 46
barwa kwiatów płatki pomarańczowe 59
barwa kwiatów płatki żółte 782
barwa kwiatów płatki liliowe 34
barwa kwiatów płatki purpurowe 99
barwa kwiatów płatki zielone 46
barwa kwiatów płatki brązowe 100
barwa kwiatów płatki szafirowe 3
barwa kwiatów płatki zielonkawe 99
typ kielicha działek 5 1
typ kielicha działki zrośnięte u podstawy 1
typ kielicha działki lancetowate 1
korona kwiatu i typ kwiatostanu kłos 365
korona kwiatu i typ kwiatostanu grono 253
korona kwiatu i typ kwiatostanu kolba 3
korona kwiatu i typ kwiatostanu podbaldachy 46
korona kwiatu i typ kwiatostanu korona o płatkach zrośnietych 3
korona kwiatu i typ kwiatostanu sierpik 8
korona kwiatu i typ kwiatostanu kotka 1
korona kwiatu i typ kwiatostanu korona o płatkach wolnych 1
korona kwiatu i typ kwiatostanu wiecha 38
korona kwiatu i typ kwiatostanu główka 155
korona kwiatu i typ kwiatostanu kwiaty zwisające 149
korona kwiatu i typ kwiatostanu wiecha złożona 9
korona kwiatu i typ kwiatostanu kwiatostan 662
korona kwiatu i typ kwiatostanu grono złożone 5
korona kwiatu i typ kwiatostanu baldachy 83
korona kwiatu i typ kwiatostanu kłos złożony 2
korona kwiatu i typ kwiatostanu Kotki wyłącznie męskie 1
korona kwiatu i typ kwiatostanu kwiat złożony 34
korona kwiatu i typ kwiatostanu baldach złożony 30
korona kwiatu i typ kwiatostanu skrętek 2
korona kwiatu i typ kwiatostanu wierzchotkowata dwuramienna 14
korona kwiatu i typ kwiatostanu wierzchotkowata wieloramienna 1
korona kwiatu i typ kwiatostanu koszyczek 251
korona kwiatu i typ kwiatostanu kwiaty duże, szerokie 1
korona kwiatu i typ kwiatostanu baldachogrono 62
obecność miodników tak 2
liczba płatków płatki trzy i mniej 46
liczba płatków płatki cztery 85
liczba płatków płatków pięć 227
liczba płatków płatków sześć i więcej 22
pręciki prątniczki 1
pręciki pylniki żółte 1
pręciki 2 1
pręciki 4 1
pręciki pylniki białawe 1
pręciki dwusilne 1
kolor pylku cytrynowożółty 1
symetria kwiatu symetria talerzykowata 8
symetria kwiatu symetria beczułkowata 11
symetria kwiatu grzbiecista, dwuwargowa 1
symetria kwiatu symetria dzwonkowata 120
symetria kwiatu symetria lejkowata 49
symetria kwiatu symetria rurkowata 122
symetria kwiatu symetria kółkowa 10
symetria kwiatu grzbiecista, wargowa 8
symetria kwiatu grzbiecista, języczkowata (5-ząbkowa) 23
symetria kwiatu grzbiecista, nibyjęzyczkowata (3-ząbkowa) 1
symetria kwiatu grzbiecista, jednowargowa 2
symetria kwiatu grzbiecista, motylkowata 77
symetria kwiatu grzbiecista, hełmowata 2
symetria kwiatu grzbiecista, z ostrogą 82
symetria kwiatu kwiat asymetryczny 1
symetria kwiatu kwiat grzbiecisty 136
symetria kwiatu kwiat promienisty 93
symetria kwiatu kwiat motylkowy 88
typ kwiatu obupłciowy 1
typ kwiatu kwiaty rozdzielnopłciowe 1
znamiona słupka słupek jeden 2
kształt blaszki liście najszersze przy końcu 200
kształt blaszki bez zielonych liści 3
kształt blaszki liście szpilkowate 1
kształt blaszki liście najszersze przy nasadzie 97
kształt blaszki liście równowąske 306
kształt blaszki podługowatolancetowate 1
kształt blaszki liście eliptycznolancetowate 8
kształt blaszki liście eliptyczne 144
kształt blaszki liście romboidalne 11
kształt blaszki liście trójkątne 98
kształt blaszki liście odwrotnie jajowate 125
kształt blaszki liście klinowate 86
kształt blaszki liście sercowate 220
kształt blaszki liście łopatkowate 58
kształt blaszki liście jajowate 866
kształt blaszki liście odwrotnie sercowate 3
kształt blaszki liście okrągłe 109
kształt blaszki liście strzałkowate 23
kształt blaszki liście lancetowate 772
kształt blaszki liście oszczepowate 16
kształt blaszki liście nerkowate 43
kształt blaszki liście wąskie i wydłużone 317
kształt blaszki wąskolancetowate 1
kształt blaszki liście najszersze w połowie długości 40
kształt blaszki igły 61
kształt blaszki okrągłosercowate 1
brzeg liścia ząbkowany 1
brzeg liścia bardzo drobno piłkowany 1
brzeg liścia całobrzegi 1
jesienna barwa liści opadające na zimę 1
jesienna barwa liści złocistożółta 1
kolor liścia od spodu niebiesko-szare 1
kolor liścia od spodu purpurowo nabiegłe 1
kolor liścia jasnozielone 1
kolor liścia ciemnozielone 1
nasada zwężona 1
nasada sercowata 1
ogonek liściowy dłuższy od blaszki liściowej 1
kolor pąków brązowe 2
liście przykwiatowe podkwiatki 1
liście przykwiatowe przysadki 1
liście przykwiatowe żółtozielone 1
przylistki szydlaste 1
przylistki słabo skręcone 1
szczyt zaostrzony 1
typ liści liść prosty 2
typ liści dłoniastozłożony 1
ulistnienie liście różyczkowe 40
ulistnienie liście skrętoległe 300
ulistnienie naprzeciwległe 245
ulistnienie okółkowe 20
ulistnienie naprzemianległe 46
ulistnienie kolczasto-ząbkowane 36
ulistnienie liście owłosione 685
ulistnienie ogonek liściowy obecny 490
ulistnienie bezogonkowe 371
ulistnienie u dołu łodygi lub odziomkowe 380
ulistnienie wcinane (wrębne, sieczne i klapowane) 301
ulistnienie ząbkowany 395
ulistnienie dłoniastodzielne 11
ulistnienie karbowany 154
ulistnienie całobrzegie 303
ulistnienie piłkowane 234
ulistnienie liście pierzaste 417
unerwienie dłoniaste 1
wcięcia blaszki wrębne 1
kolor nasion żółte 5
kolor nasion czarnobrązowe 1
rozsiewanie nasion autochoria 1
wielkość nasion faliste 1
wielkość nasion jajowate 1
wielkość nasion drobne 1
wielkość nasion poniżej 4mm 1
kolor owoców brązowe 229
kolor owoców czerwone 161
kolor owoców szare 28
kolor owoców brązowawożółte 1
kolor owoców fioletowe 16
kolor owoców białe 69
kolor owoców pomarańczowe 24
kolor owoców purpurowe 9
kolor owoców zielone 118
kolor owoców niebieskie 18
kolor owoców żółte 139
kolor owoców czarne 137
rodzaj owoców mieszek 48
rodzaj owoców puch kielichowy 124
rodzaj owoców torebki 526
rodzaj owoców jagoda 79
rodzaj owoców kuliste 319
rodzaj owoców Szypułki owoców wykazują fototropizm ujemny 1
rodzaj owoców niełupki 267
rodzaj owoców duże 24
rodzaj owoców ziarniak 72
rodzaj owoców strąki 108
rodzaj owoców pestkowiec 76
rodzaj owoców orzechy 219
rodzaj owoców skrzydełka 109
rodzaj owoców łuszczyna 86
rodzaj owoców słabo kolczaste 1
rodzaj owoców rozłupki 151
rodzaj owoców 2-komorowe 2
rodzaj owoców gładkie 1
powierzchnia owocu kolczasta 14
powierzchnia owocu żeberkowana 54
powierzchnia owocu gładka 96
powierzchnia owocu szorstka 13
powierzchnia owocu owłosiona 227
powierzchnia owocu kanciasta 51
powierzchnia owocu pomarszczona 35
cechy pędu młode pędy cienkie 1
cechy pędu młode pędy jasnożółte 1
sok pędu sok mleczny 16
wygląd łodygi łodyga żebrowana 7
wygląd łodygi łodyga gładka 377
wygląd łodygi purpurowo nabiegła 1
wygląd łodygi łodyga omszona 58
wygląd łodygi słabo ulistniona 1
wygląd łodygi rozesłana 1
wygląd łodygi łodyga kolczasta 19
wygląd łodygi łodyga wzniesiona 648
wygląd łodygi łodyga pełzająca 229
wygląd łodygi łodyga trójkanciasta 48
wygląd łodygi łodyga czterokanciasta 67
wygląd łodygi pełzające kłącza 1
wygląd łodygi łodyga gałęzista 720
wygląd łodygi naga 1
wygląd łodygi łodyga szorstka 113
wygląd łodygi kłącze poziome 1
wygląd łodygi łodyga owłosiona 692
wygląd łodygi skąpokwiatowa 1
szacowana wysokość łodygi wyższa od człowieka (> 200 cm) 318
szacowana wysokość łodygi długość 10-80 cm 1
szacowana wysokość łodygi do kostki (0 < x < 15 cm) 128
szacowana wysokość łodygi od kolana do pasa (60 < x < 100 cm) 379
szacowana wysokość łodygi od pasa do wysokości człowieka (100 < x < 200 cm) 241
zapach łodygi zapach czosnkowy 2
zapach łodygi zapach nieprzyjemny 9
zapach łodygi zapach aromatyczny 19
pora kwitnienia luty 10
pora kwitnienia marzec 66
pora kwitnienia kwiecień 233
pora kwitnienia maj 645
pora kwitnienia czerwiec 1065
pora kwitnienia lipiec 1166
pora kwitnienia sierpień 915
pora kwitnienia wrzesień 465
pora kwitnienia październik 137
pora kwitnienia przy zaawansowanym rozwoju liści 1
pora kwitnienia listopad 7
pora kwitnienia grudzień 1
pora kwitnienia równnoczesne z rozwojem liści 1
siedlisko Widne lasy, zarośla i zręby 1
siedlisko Wzgórza i pagórki 1
siedlisko Przy drogach i torach kolejowych 1
siedlisko skały, mury, skarpy 1
siedlisko polany 1
siedlisko zarośla 1
siedlisko do nasadzeń nadwodnych 1
siedlisko umocnienia koryt rzecznych 1
siedlisko wapienne ściany skalne 1
siedlisko Brzegi wód 2
siedlisko Tereny ruderalne. Siedliska antropogeniczne 1
gatunek charakterystyczny dla Potentilletalia caulescentis wapienne ściany skalne ... (8210) 1
gatunek charakterystyczny dla Quercetalia pubescenti-petraeae Klika 1933 corr. Moravec in Beg. et Theurill 1984 świetliste dąbrowy; ciepłolubne dąbowy (91I0) 1

Aktualizacja bazy danych

Korzystając z powyżej przedstawionego schematu, robot sprawdza co tydzień czy pojawiły się nowe rośliny w polskiej Wikipedii oraz czy obecne już w naszej bazie rośliny nie zostały zaktualizowane - jeśli tak, nanosi poprawki w atlasie.

Jak wynika z powyższego opisu, by uaktualnić bazę atlasu należy uaktualnić polską Wikipedię. Zachęcamy do samodzielnego dodawania artykułów o polskich roślinach (można to zrobić bez zakładania konta) - nie tylko wzbogacisz Wikipedię, ale jednocześnie atlas. Oczywiście Wikipedia (czy bardziej ogólnie - Wikimedia) umożliwia również dodawanie zdjęć roślin.

Jeśli jesteś zainteresowana/y dodaniem nowych roślin do Wikipedii, poniżej przygotowaliśmy spis pozycji, które prawdopodobnie występują w Polsce, ale nie występują w Wikipedii:

Warto pamiętać, że polscy Wikipedyści tworzą artykuły dotyczące roślin według pewnego schematu, który jest opisany tutaj.

Jeśli brakuje w atlasie rośliny, która jest obecna w Wikipedii, możesz albo nam o tym napisać, albo uzupełnić któryś z poniższych spisów roślin w Wikipedii:

Rozpoznawanie roślin na podstawie zdjęć

Rozpoznawanie wykorzystuje sieć neuronową resnet 101 wytrenowaną na podstawie zdjęć z atlasu za pomocą mxnet. Model można pobrać tutaj (licencja GPL).

Dokładność algorytmu rozpoznawania roślin na podstawie zdjęcia*:

w 78.67%przypadków roślina ze zdjęcia pojawia sięjako pierwsza na liście wyników
w 88.42%w pierwszej trójce
w 91.39%w pierwszej piątce
w 94.21%w pierwszej dziesiątce
w 95.43%w pierwszej piętnastce
* - wyniki dla 5860 losowych, ogólnodostępnych w internecie zdjęć roślin, po wyłączeniu zdjęć użytych do trenowania i walidacji sieci neuronowej

Licencja

Zawartość atlasu udostępniana jest na zasadach licencji Creative Commons BY-SA 3.0, ponieważ pochodzą one z Wikipedii. Zdjęcia natomiast opatrzone są informacją o licencji i autorstwie przy powiększeniu ich do pełnego rozmiaru. Jest to zazwyczaj licencja z rodziny Creative Commons lub domena publiczna. Jeśli Twoje zdjęcie znalazło się tu wbrew licencji, zgłoś to nam korzystając z przycisku Zgłoś błąd po prawej stronie okna.

Kod źródłowy

Kod źródłowy atlasu roślin jak i aplikacji na telefony mobilne można pobrać z repozytorium. Kod udostępniany jest na wolnej licencji GPL.