Jak to działa

Poniżej wyjaśnimy w jaki sposób to wszystko funkcjonuje. W skrócie - stworzyliśmy robota, który robi większość czynności za nas, korzystając z otwartych informacji polskiej Wikipedii.

Tworzenie listy roślin występujących w Polsce

Robot czyta nazwy łacińskie roślin wyszczególnionych w następujących artykułach z Wikipedii:

Sprawdzanie poprawności nazw i poszukiwanie synonimów

Po zebraniu nazw łacińskich roślin, robot korzysta z bazy The Plant List sprawdzając, czy dana nazwa jest nazwą główną, czy synonimem. Jeśli okazuje się synonimem - korzysta z nazwy głównej. .

Pobieranie informacji z Wikipedii

Robot ściąga artykuły dla roślin obecnych w Wikipedii, a następnie przetwarza je tak, by uzyskać jak najwięcej informacji na temat morfologii. Uzyskane w ten sposób cechy grupuje w sposób zdefiniowany przez nas i dodaje do bazy danych atlasu.

Następnie robot poszukuje taksonomii danej rośliny w bazie GBIF i dodaje wynik do bazy atlasu. W ostatnim etapie, korzystając z API Wikipedii, robot pobiera zdjęcia roślin z polskiej Wikipedii oraz z Wikimedia. Informacje o autorstwie zdjęć i zasadach udostępniania są pobierane z użyciem API wmflabs.

Dodatkowe zdjęcia robot pobiera ze strony http://www.actaplantarum.org/acta/galleria.php udostępnianych na zasadach Creative Commons Attribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 International License oraz z http://www.biolib.de udostępniającej skany z książek botanicznych, które przeszły do Domeny Publicznej.

Potwierdzanie informacji

Wpisy dotyczące nowych roślin są przeglądane przez człowieka, cechy charakterystyczne są na tym etapie ewentualnie modyfikowane. Zduplikowane zdjęcia również są usuwane. Uwaga: nie jesteśmy w stanie na bieżąco przeglądać bazy (zapraszamy do współpracy!), dlatego zawsze podchodź do prezentowanych tu informacji ostrożnie i potwierdź w innych źródłach.

Zawartość bazy danych

Baza zawiera 2447 roślin rosnących dziko bądź w uprawie na terenie Polski. Baza zawiera również 84756 miejsc występowania roślin z bazy GBIF oraz 463 wprowadzonych przez Użytkowników atlasu. Dla łatwiejszej identyfikacji, baza zawiera 68899 zdjęć (+ 3323 dodanych przez Użytkowników) różnych części roślin udostępnianych w Internecie na zasadach Creative Commons bądź będących w domenie publicznej.
Nie wszystkie rośliny występują w bazie: z informacji o roślinach występujących w Polsce [1, 2, 3] wynika, że brakuje nam około 912 roślin (zobacz poniżej jak możesz to zmienić), co więcej - w przypadku 80 roślin nie posiadamy zdjęć co znacznie utrudnia ich identyfikację (zobacz poniżej jak możesz to zmienić). Wierzymy, że z upływem czasu baza będzie systematycznie uzupełniana, m.in. dzięki Wam.

Histogram liczby cech przypisanych roślinom

Statystyki poszczególnych cech przypisanych roślinom

GrupaCecha# roślin
ogólne bylina 1242
ogólne roślina pyłkodajna 127
ogólne roślina miododajna 171
ogólne ścisła ochrona gatunkowa 1
ogólne Polska Czerwona Księga Roślin 1
ogólne roślina barwierska 24
ogólne roślina górska 2
ogólne roślina reliktowa 1
ogólne pnącze 32
ogólne roślina zimozielona 3
ogólne krzewinka 34
ogólne kenofit 3
ogólne roślina ozdobna 676
ogólne roślina nadwodna 1
ogólne roślina inwazyjna 71
ogólne roślina żywicielska 1
ogólne drzewo 273
ogólne roślina ekspansywna 63
ogólne krzew 210
ogólne chwast 224
ogólne roślina wodna 123
ogólne roślina pionierska 15
ogólne roślina trująca 304
ogólne roślina chroniona 111
ogólne roślina lecznicza 458
ogólne roślina użytkowa 1063
ogólne roślina jadalna 263
cechy kory kora z przetchlinkami 1
cechy korony wysoko rozgałęziona 1
forma życiowa wg Raunkiæra hemikryptofit 3
forma życiowa wg Raunkiæra hydrofit 1
forma życiowa wg Raunkiæra helofit 1
forma życiowa wg Raunkiæra megafanerofit 3
kolor igieł ciemnozielone 1
ułożenie igieł równomiernie na gałęziach 1
wierzchołek igieł ostry 1
wygląd igieł sztywne 1
wygląd igieł na przekroju kwadratowe 1
wygląd igieł krótkie 1
wygląd igieł bardzo kłujące 1
kolor kory szara 1
kolor kory brunatnoszara 1
kolor kory brunatnoczerwonawa 1
spekania kory łuskowate 1
kształt Korzenie podziemne 4
barwa kwiatów płatki żółte 736
barwa kwiatów płatki zielone 57
barwa kwiatów płatki brązowe 97
barwa kwiatów płatki pomarańczowe 58
barwa kwiatów płatki purpurowe 92
barwa kwiatów płatki białe 788
barwa kwiatów płatki brudnobiałe 9
barwa kwiatów płatki różowe 382
barwa kwiatów płatki kremowe 39
barwa kwiatów płatki czerwone 343
barwa kwiatów płatki liliowe 34
barwa kwiatów płatki fioletowe 321
barwa kwiatów płatki szafirowe 2
barwa kwiatów płatki niebieskie 179
barwa kwiatów płatki zielonkawe 86
barwa kwiatów rurkowatych rdzawa 1
barwa kwiatów rurkowatych żółta 2
barwa kwiatów rurkowatych pomarańczowa 1
typ kielicha wolnodziałkowy 3
typ kielicha dzwonkowaty 4
typ kielicha rurkowaty 2
typ kielicha wargowy 2
typ kielicha beczułkowaty 1
kształt korony korona o płatkach wolnych 8
kształt korony wiecha złożona 6
kształt korony koszyczek 236
kształt korony kwiaty zwisające 142
kształt korony grono złożone 5
kształt korony baldachogrono 52
kształt korony kwiatostan 618
kształt korony kłos złożony 2
kształt korony baldachy 90
kształt korony podbaldachy 46
kształt korony baldach złożony 29
kształt korony kwiat złożony 31
kształt korony skrętek 1
kształt korony wierzchotkowata dwuramienna 12
kształt korony grono 234
kształt korony wierzchotkowata wieloramienna 2
kształt korony sierpik 8
kształt korony wiecha 37
kształt korony kłos 329
kształt korony kolba 3
kształt korony kotka 2
kształt korony baldaszek 1
kształt korony korona o płatkach zrośnietych 6
kształt korony główka 137
obecność miodników tak 2
obecność miodników nie 1
pienność roślina jednopienna 1
liczba płatków płatki trzy i mniej 44
liczba płatków płatki cztery 83
liczba płatków płatków pięć 228
liczba płatków płatków sześć i więcej 19
pręciki jednakowej długości 2
pręciki dwusilne 1
pręciki rurka 3
symetria kwiatu kwiat grzbiecisty 132
symetria kwiatu symetria talerzykowata 8
symetria kwiatu kwiat motylkowy 84
symetria kwiatu symetria beczułkowata 9
symetria kwiatu symetria dzwonkowata 100
symetria kwiatu symetria lejkowata 45
symetria kwiatu symetria rurkowata 107
symetria kwiatu symetria kółkowa 10
symetria kwiatu kwiat promienisty 96
symetria kwiatu grzbiecista, wargowa 10
symetria kwiatu grzbiecista, języczkowata (5-ząbkowa) 19
symetria kwiatu grzbiecista, nibyjęzyczkowata (3-ząbkowa) 1
symetria kwiatu grzbiecista, jednowargowa 2
symetria kwiatu grzbiecista, motylkowata 69
symetria kwiatu grzbiecista, hełmowata 3
symetria kwiatu grzbiecista, z ostrogą 82
symetria kwiatu kwiat asymetryczny 1
typ kwiatu pręcikowy 4
typ kwiatu słupkowy 6
typ kwiatu obupłciowy 8
znamiona słupka dwudzielne 2
znamiona słupka wielodzielne 2
kształt blaszki skórzaste 2
kształt blaszki igły 61
kształt blaszki liście sercowate 211
kształt blaszki bez zielonych liści 2
kształt blaszki liście szpilkowate 2
kształt blaszki liście jajowate 819
kształt blaszki liście równowąske 286
kształt blaszki liście okrągłe 98
kształt blaszki liście eliptycznolancetowate 8
kształt blaszki liście lancetowate 737
kształt blaszki liście trójkątne 85
kształt blaszki liście eliptyczne 135
kształt blaszki liście nerkowate 41
kształt blaszki liście odwrotnie jajowate 120
kształt blaszki liście romboidalne 11
kształt blaszki liście wąskie i wydłużone 303
kształt blaszki liście klinowate 80
kształt blaszki liście najszersze w połowie długości 39
kształt blaszki liście łopatkowate 55
kształt blaszki liście najszersze przy końcu 188
kształt blaszki liście odwrotnie sercowate 3
kształt blaszki liście najszersze przy nasadzie 90
kształt blaszki liście strzałkowate 22
kształt blaszki liście oszczepowate 16
brzeg liścia falisty 1
brzeg liścia orzęsiony 2
brzeg liścia podwójnie piłkowany 2
brzeg liścia całobrzegi 9
brzeg liścia piłkowany 6
brzeg liścia karbowany 4
brzeg liścia ząbkowany 11
kolor liścia jasnozielone 1
kolor liścia żywozielone 8
kolor liścia ciemnozielone 4
nasada zaokrąglona 2
nasada sercowata 4
nasada strzałkowata 1
nasada klinowata 1
ogonek liściowy spłaszczony 1
liście przykwiatowe pokrywy 1
liście przykwiatowe pokrywki 2
liście przykwiatowe kieliszek (pod kielichem) 2
liście przykwiatowe podkwiatki 2
liście przykwiatowe przysadki 3
liście przykwiatowe okrywy koszyczków 3
przylistki liściaste 2
szczyt tępy 5
szczyt zaokrąglony 1
szczyt ostry 4
szczyt zaostrzony 5
typ liści liść prosty 14
typ liści dłoniastozłożony 1
typ liści parzyście pierzastozłożony 1
typ liści nieparzyście pierzastozłożony 9
ulistnienie liście owłosione 647
ulistnienie ogonek liściowy obecny 469
ulistnienie bezogonkowe 354
ulistnienie u dołu łodygi lub odziomkowe 366
ulistnienie wcinane (wrębne, sieczne i klapowane) 293
ulistnienie ząbkowany 371
ulistnienie karbowany 148
ulistnienie pojedyncze ząbkowane 2
ulistnienie całobrzegie 276
ulistnienie piłkowane 220
ulistnienie kolczasto-ząbkowane 36
ulistnienie liście pierzaste 403
ulistnienie liście różyczkowe 39
ulistnienie liście skrętoległe 272
ulistnienie naprzeciwległe 232
ulistnienie okółkowe 17
ulistnienie dłoniastodzielne 13
ulistnienie naprzemianległe 42
unerwienie równoległe 1
unerwienie pierzaste 14
wcięcia blaszki trójklapowe 1
wcięcia blaszki pięcioklapowe 3
wcięcia blaszki pierzastodzielne 1
kolor nasion czarne 5
kolor nasion czerwone 1
kolor nasion żółte 4
kolor nasion brązowe 8
rozsiewanie nasion antropochoria 1
rozsiewanie nasion anemochoria 5
rozsiewanie nasion myrmekochoria 2
rozsiewanie nasion zoochoria 1
rozsiewanie nasion ballochoria 1
wielkość nasion poniżej 4mm 9
kolor owoców zielone 106
kolor owoców niebieskie 17
kolor owoców czarne 120
kolor owoców brązowe 213
kolor owoców czerwone 148
kolor owoców szare 25
kolor owoców fioletowe 13
kolor owoców białe 61
kolor owoców żółte 131
kolor owoców pomarańczowe 25
kolor owoców purpurowe 6
rodzaj owoców kuliste 283
rodzaj owoców niełupki 266
rodzaj owoców duże 19
rodzaj owoców ziarniak 56
rodzaj owoców strąki 104
rodzaj owoców orzechy 214
rodzaj owoców puch kielichowy 115
rodzaj owoców łuszczyna 85
rodzaj owoców rozłupki 144
rodzaj owoców pestkowiec 60
rodzaj owoców mieszek 46
rodzaj owoców torebki 496
rodzaj owoców skrzydełka 106
rodzaj owoców jagoda 75
powierzchnia owocu kolczasta 15
powierzchnia owocu pomarszczona 31
powierzchnia owocu żeberkowana 56
powierzchnia owocu gładka 93
powierzchnia owocu szorstka 12
powierzchnia owocu owłosiona 205
powierzchnia owocu kanciasta 48
sok pędu sok mleczny 17
wygląd łodygi łodyga prosta 2
wygląd łodygi łodyga pełzająca 220
wygląd łodygi łodyga omszona 52
wygląd łodygi łodyga trójkanciasta 47
wygląd łodygi łodyga czterokanciasta 69
wygląd łodygi łodyga gałęzista 701
wygląd łodygi łodyga szorstka 109
wygląd łodygi łodyga owłosiona 666
wygląd łodygi łodyga kolczasta 14
wygląd łodygi łodyga żebrowana 9
wygląd łodygi łodyga wzniesiona 608
wygląd łodygi łodyga gładka 364
szacowana wysokość łodygi do kostki (0 < x < 15 cm) 126
szacowana wysokość łodygi od kostki do kolana (15< x <60 cm) 15
szacowana wysokość łodygi od kolana do pasa (60 < x < 100 cm) 371
szacowana wysokość łodygi od pasa do wysokości człowieka (100 < x < 200 cm) 232
szacowana wysokość łodygi wyższa od człowieka (> 200 cm) 269
zapach łodygi zapach aromatyczny 20
zapach łodygi zapach czosnkowy 2
zapach łodygi zapach nieprzyjemny 10
pora kwitnienia lipiec 1132
pora kwitnienia sierpień 892
pora kwitnienia wrzesień 455
pora kwitnienia październik 135
pora kwitnienia listopad 9
pora kwitnienia grudzień 3
pora kwitnienia styczeń 1
pora kwitnienia luty 9
pora kwitnienia marzec 69
pora kwitnienia kwiecień 231
pora kwitnienia maj 625
pora kwitnienia czerwiec 1039
siedlisko Polany leśne 3
siedlisko Wilgotne pola i przydroża 1
siedlisko Bory bagienne 1
siedlisko Mokre łąki, pastwiska i miedze 1
siedlisko Torfowiska wysokie 1
siedlisko Słoneczne łąki i murawy 1
siedlisko Regiel dolny 1
siedlisko Skraje lasów 3
siedlisko Regiel górny 2
siedlisko Widne lasy, zarośla i zręby 4
siedlisko Buczyny 1
siedlisko Dąbrowy 1
siedlisko Wrzosowiska 1
siedlisko Torfowisk 1
siedlisko Gleby suche i piaszczyste 1
siedlisko Podszyt lasów liściastych 1
siedlisko Bory mieszane 1
siedlisko Górskie łąki i hale 2
siedlisko Wilgotne lasy i zarośla 2
siedlisko Brzegi wód 3
siedlisko Tereny podmokłe i zabagnione 1
siedlisko Piętro kosodrzewiny 1
siedlisko Lasy liściaste 3
inne cechy szyszek opadają w całości 1
kolor szyszek jasnobrązowe 1
kształt szyszki gładkie 1
ułożenie szyszek zwisające 1
wielkość szyszek 10-15 cm 1

Aktualizacja bazy danych

Korzystając z powyżej przedstawionego schematu, robot sprawdza co tydzień czy pojawiły się nowe rośliny w polskiej Wikipedii oraz czy obecne już w naszej bazie rośliny nie zostały zaktualizowane - jeśli tak, nanosi poprawki w atlasie.

Jak wynika z powyższego opisu, by uaktualnić bazę atlasu należy uaktualnić polską Wikipedię. Zachęcamy do samodzielnego dodawania artykułów o polskich roślinach (można to zrobić bez zakładania konta) - nie tylko wzbogacisz Wikipedię, ale jednocześnie atlas. Oczywiście Wikipedia (czy bardziej ogólnie - Wikimedia) umożliwia również dodawanie zdjęć roślin.

Jeśli jesteś zainteresowana/y dodaniem nowych roślin do Wikipedii, poniżej przygotowaliśmy spis pozycji, które prawdopodobnie występują w Polsce, ale nie występują w Wikipedii:

Warto pamiętać, że polscy Wikipedyści tworzą artykuły dotyczące roślin według pewnego schematu, który jest opisany tutaj.

Jeśli brakuje w atlasie rośliny, która jest obecna w Wikipedii, możesz albo nam o tym napisać, albo uzupełnić któryś z poniższych spisów roślin w Wikipedii:

Rozpoznawanie roślin na podstawie zdjęć

Rozpoznawanie wykorzystuje sieć neuronową resnet 101 wytrenowaną na podstawie zdjęć z atlasu za pomocą mxnet. Model można pobrać tutaj (licencja GPL).

Dokładność algorytmu rozpoznawania roślin na podstawie zdjęcia*:

w 77%przypadków roślina ze zdjęcia pojawia sięjako pierwsza na liście wyników
w 91%w pierwszej piątce
* - wyniki dla 25642 losowych, ogólnodostępnych w internecie zdjęć roślin, po wyłączeniu zdjęć użytych do trenowania sieci neuronowej (validation set, dlatego w rzeczywistości dokładność będzie nieznacznie mniejsza)

Licencja

Zawartość atlasu udostępniana jest na zasadach licencji Creative Commons BY-SA 3.0, ponieważ pochodzą one z Wikipedii. Zdjęcia natomiast opatrzone są informacją o licencji i autorstwie przy powiększeniu ich do pełnego rozmiaru. Jest to zazwyczaj licencja z rodziny Creative Commons lub domena publiczna. Jeśli Twoje zdjęcie znalazło się tu wbrew licencji, zgłoś to nam korzystając z przycisku Zgłoś błąd po prawej stronie okna.

Kod źródłowy

Kod źródłowy atlasu roślin jak i aplikacji na telefony mobilne można pobrać z repozytorium. Kod udostępniany jest na wolnej licencji GPL.